木材自身的水份會影響木箱的品質，如收縮、變形甚至裂開。

在生產出口木箱的過程中，應嚴格控制含水量指標。

出口木箱變色的原因有很多：

1、木材發霉

長霉的木材會讓木箱表層變色，它是由霉菌引起的。霉菌對環境和基質的適應性和耐受力強過蘭草細菌和爛掉病菌。霉菌對化學藥品也有極強的抵抗力，甚至在接觸一些有害化學藥品時也能生長。因此，一些木箱經過防銹處理后仍會發覺霉菌。霉菌常使木箱呈綠色、白色、黑色，偶爾也有其他色調。霉菌引起的變色一般是絮狀或斑點狀的。在溫暖潮濕的氣候或通風不良的環境里，容易使沉積在木材表層的霉菌孢子繁殖和生長霉菌。

2、木材的化學變色

很多樹種的木材在含水量高或長期曝露在潮濕空氣中時會變色。它不是由木材的病菌感染引起的，而是由木材中一些成分化學反映引起的，稱為化學變色。木材中單寧、色素、黃酮、糖、酚和其它有機物質的氧化縮合，其中主要的是木材中酚的氧化。